CALYPSO-Software
Umfassende Interaktionsanalyse.
Die CALYPSO-Software ist ein vielseitiges, einzigartiges Werkzeug zur schnellen und zuverlässigen Charakterisierung eines breiten Spektrums molekularer Wechselwirkungen mit Hilfe der Statischen Mehrwinkel-Lichtstreuung mit Zusammensetzungsgradienten (CG-MALS). Die CALYPSO-Software integriert intelligentes Methodendesign, einfache Hardwaresteuerung und robuste Datenerfassung für einen reibungslosen Versuchsablauf. Sobald die Messung abgeschlossen ist, führt die intuitive grafische Benutzeroberfläche den Benutzer durch die Datenverarbeitung für eine schnelle und leistungsstarke Analyse makromolekularer Wechselwirkungen.
Erfahren Sie, wie Sie die Wechselwirkungen zwischen Ihren Makromolekülen erforschen können.
Erstellen Sie Methoden zur Analyse von Selbst- oder Hetero-Assoziation.
Spezifische, reversible Wechselwirkungen - Proteinbindungsstudien
Die CALYPSO-Software verwendet CG-MALS-Daten zur Berechnung der Affinität und Stöchiometrie spezifischer, reversibler Komplexe, die in Lösung gebildet werden, wie z. B. Antikörper-Antigen-Wechselwirkungen und Protein-Dimerisierung. Die Software ermöglicht eine schnelle Anpassung der Daten an einfache Modelle der Dimerbildung, 1:n-Stöchiometrien und Selbstassoziation. Alternativ können Sie mit den vielseitigen Analysewerkzeugen komplexere Bindungsschemata auswählen und entwerfen, einschließlich gleichzeitiger Selbst- und Hetero-Assoziation, Kooperativität und Metakomplexbildung.
Unspezifische Wechselwirkungen – Virialkoeffizienten
Der zweite Virialkoeffizient (A2) wird zur Quantifizierung unspezifischer attraktiver und repulsiver Wechselwirkungen für Proteine, Polymere und Kolloide verwendet. Batch-Lichtstreudaten, die mit der CALYPSO-Software erfasst wurden, können mit dem Zimm-Formalismus, dem Debye-Formalismus oder der effektiven Hartkugel-Approximation analysiert werden. Es können auch höhere Virialkoeffizienten bestimmt werden.
Zeitabhängige MALS-Assoziations- und Dissoziationskinetik
Einige Protein-Assoziations- oder Dissoziationsreaktionen können Sekunden oder Minuten dauern, bis sie abgeschlossen sind. Die CALYPSO-Software gibt Ihnen die Möglichkeit, die Zeit einzustellen, die jede Zusammensetzung benötigt, um ins Gleichgewicht zu kommen. Zeiten von einigen Sekunden bis zu mehreren Stunden sind wählbar. In dem unten abgebildeten Beispiel wurden verschiedene Konzentrationen eines niedermolekularen Inhibitors verwendet, um die Dimerisierung eines Proteins zu unterbinden. Die Abnahme der Lichtstreuung entspricht der Dissoziation der Dimere in Monomere im Laufe der Zeit.
Lichtstreu- und Konzentrationsmessung
Maximale Vielseitigkeit beim Experimentieren bietet die Echtzeitanzeige Ihrer Lichtstreu- und Konzentrationsdaten mit einer Zeitleiste, die Ihnen genau anzeigt, wie weit Ihr Experiment gelaufen ist. Analysieren Sie die Daten, während sie gesammelt werden, um den Fortschritt Ihres Experiments zu überwachen und zu bewerten. Unterbrechen und modifizieren Sie Ihre Methode jederzeit, um Parameter zu optimieren und zu ändern, z. B. die Messzeiten zu erhöhen, um lange Kinetiken zu berücksichtigen.
Gleichzeitige Erfassung mit ASTRA
Lichtstreuung mit dem DAWN® oder miniDAWN® und Konzentrationsdaten von einem Differenzial-Brechungsindex-Detektor wie dem Optilab® oder einem UV-Detektor können mit ASTRA®.
Flexible Konzentrationsdetektion
Verwenden Sie entweder UV- oder RI-Konzentrationsdetektoren oder nominale Konzentrationen, die auf den berechneten Verdünnungen basieren. Diese Werte werden automatisch berechnet und mit Ihren Daten gespeichert. Die Konzentrationsdetektionsmodi können nach der Erfassung einfach ausgewählt werden.
Calypso Pumpensteuerungen
Mit der CALYPSO-Software können Sie jeden Parameter Ihres CG-MALS-Experiments individuell anpassen und haben so die volle Kontrolle über Ihr interaktives System. Schalten Sie den Entgaser ein, stellen Sie die maximal zulässigen Flussraten und Drücke ein und führen Sie Priming- und Waschschritte durch, um Ihre Hardware für ein Experiment vorzubereiten. Fluss- und Waschparameter können in einer Experimentmethode für vollständige, unbeaufsichtigte Experimente programmiert werden.
Zubehör
Externe Geräte können problemlos mit dem Calypso® verbunden werden. Das Calypso® kann externe Ventile steuern, um die Systemwartung zu vereinfachen. Verwenden Sie einen Orbit™ Lösungsmittel-Recycler um Lösungsmittel durch Ihr System zu pumpen, wenn es nicht verwendet wird. Schalten Sie mit einem externen Zwei-Positionen-Ventil zwischen zwei Waschpuffern um, um das System nach einem Experiment vollständig zu spülen. Beide Funktionen können innerhalb einer Methode für eine schnelle und einfache Reinigung automatisiert werden.
Methoden-Design
Entwerfen Sie Ihren eigenen Zusammensetzungsgradienten oder verwenden Sie eine der in der Software integrierten Methoden, um verschiedene makromolekulare Wechselwirkungen zu untersuchen. Eine beliebige Anzahl von Zusammensetzungsgradienten kann in einem einzigen Experiment ausgeführt werden, Wiederholungsläufe können in eigenen Dateien gespeichert werden, und das System kann gespült und für den folgenden Einsatz am nächsten Morgen vorbereitet werden. Alles wird von einer einzigen Methodenseite aus gesteuert. Zusätzlich zu den mitgelieferten Beispielmethoden können benutzerdefinierte Methoden zur späteren Verwendung gespeichert werden.
Simulationen
Ganz gleich, ob Sie bereits ein Experiment durchgeführt haben und die Parameter optimieren möchten oder ob Sie mit dem Entwurf Ihres ersten Calypso-Experiments beginnen möchten, die CALYPSO-Software bietet wichtige Simulationsfunktionen zur Unterstützung des Experimententwurfs. Geben Sie Parameter wie Molekulargewichte, Virialkoeffizienten, Assoziationsstöchiometrien und Gleichgewichtsassoziationskonstanten (KA), ein. Die Simulationsfunktion stellt die vorhergesagten Lichtstreudaten für bis zu 5 Modelle dar. Mit diesen Informationen können Sie geeignete Lösungskonzentrationen für Ihr Experiment sowie die optimalen Zusammensetzungsgradientenschritte bestimmen.
Berechnungen
Die CALYPSO-Software enthält Rechner, die Sie bei der Versuchsplanung und der Auswertung der Ergebnisse unterstützen: Verwenden Sie den A2-Rechner, um das ausgeschlossene Volumen A2 vorherzusagen und einen geeigneten Konzentrationsbereich auszuwählen. Der dn/dc-Rechner hilft Ihnen, die Änderung des dn/dc-Wertes Ihres Moleküls in Puffern mit unterschiedlichem Brechungsindex abzuschätzen. Der KD-Rechner berechnet die Gleichgewichtsdissoziationskonstante KD für eine oder zwei Bindungsstellen und hilft bei der Untersuchung von Kooperativität.
Anforderungen an den Host-Computer
Einzelheiten zu der von CALYPSO benötigten Computerhardware und dem Betriebssystem finden Sie unter Anforderungen an den Host-Computer .